史瑞克（麦克·梅尔斯 配音）原以为可以和费奥娜（卡梅隆·迪亚茨 配音）在沼泽地过上自由散漫的生活，谁知道费奥娜的父亲，变成青蛙的“遥远王国”国王病重，史瑞克和费奥娜不得不放弃自由，继承王国。对史瑞克而言，“祸不单行”：费奥娜怀孕了，显然他没有做好当爸爸的准备。因为不想继承王国，也因为即将出生的小怪物，史瑞克带着话痨驴子（艾迪·墨菲 配音）和穿靴子的猫，一同去找菲奥娜的远方堂弟亚蒂（贾斯汀·汀布莱克 配音），在他们的软磨硬泡之下，懒散的亚蒂终于答应接过王位这个烫手山芋，四人开始了热闹非凡的回国之旅。