在《海底小纵队 中国之旅 第三季》中，海底小纵队继续深入探索中国，足迹遍布奔腾的黄河、浩瀚的鄱阳湖，神秘的墨脱雨林、幽深的神农架、壮美的黄果树瀑布、奇特的红海滩，以及世界屋脊青藏高原和广袤的新疆荒漠。队员们不仅救助洄游遇险的胭脂鱼、误食毒蘑菇的白化黑熊等动物，还一起见证新疆荒漠极光奇观，利用仿生学打造“夜枭艇”、引导瓜头鲸群协作抗灾、认识亚洲象作为“雨林工程师”的贡献、中华鳑鲏与河蚌的精妙共生、高原鼢鼠“破坏者”与“建设者”的双重生态价值等等。海底小纵队的每次行动，都生动诠释了尊重自然规律，维护生物多样性及生态平衡的核心理念。