年轻的X教授查尔斯（詹姆斯·麦卡沃伊 饰）和万磁王艾瑞克（迈克尔·法斯宾德 饰）是一对志向相投的好朋友。他们最早发现了自己的超能力，并与其他几个变种人一起在CIA工作。引发艾瑞克超能力的纳粹战争贩子肖（凯文·贝肯 饰）一直试图挑起核战争，并想方设法挑起美苏两国的矛盾。艾瑞克和查尔斯一直与肖手下的变种人战斗，努力阻止肖的阴谋。肖怂恿苏联引发古巴导弹危机，查尔斯和艾瑞克获知消息后，在海湾与肖手下的变种人拉开了对决的一战。最终，肖被查尔斯和艾瑞克合力消灭。可是，在这个过程中，艾瑞克逐渐被肖的政治观点影响，与查尔斯产生裂痕。通过海湾的这一战，艾瑞克和查尔斯最终决裂，一方变成支持人类与变种人和平共存的X教授；另一方坚持通过消灭人类换来变种人兴起的观点，自称万磁王……